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양성세포선별은 유전자편집의 핵심고리로서 그 효률은 실험주기와 성공률에 직접적인 영향을 준다.
핵심 목표
혼합 세포군에서 성공적으로 편집된 세포 (예: 유전자 제거 / KO, 두드리기 / KI) 를 분리합니다.
야생형 세포의 간섭을 배제한다 (미편집 세포의 비중이 높을 경우 가음성을 초래하기 쉽다).
주요 과제
세포 손상: 장기 선별로 인한 세포 노화 (돼지 섬유질 세포의 대물림 후 증식 능력 급락).
가짜 양성 위험: 일부 편집은 wan이 유전자 기능을 완전히 파괴하지 않았다 (예를 들어 디코딩 돌연변이는 기능 상실을 초래하지 않았다).
전체 병목 현상: 기존 단일 클론 배양은 22일 이상 걸리며 양성률은 20% 미만입니다.
복구 메커니즘을 사용하여 형광/저항성 표식 표현을 트리거하여 시각화 및 신속한 선별을 실현합니다.
| 메커니즘 수정 | 시스템 설계 보고 | 필터링 방법 | 우위 | 케이스 |
|---|---|---|---|---|
| 숫자 | 표적파괴 형광단백질 종지자→회복표현 | FACS GFP ⁺세포 선별 | 직관적이고 효율적인 KO | CRISPR-DIY 캐리어 |
| HDR는 | 동원 재조합 삽입 항성 유전자(예: Puroᵣ) | 항생제 스트레스 선별 | 낮은 비용으로 KI에 적합 | 벽운천 크리스퍼 입자 |
| SSA는 | 단열 유도 단사슬 퇴화 복구 → 형광단백질 재구성 | 유식세포술 | 감도가 높고 과녁 이탈률이 낮다. | 다중 유전자 편집 검증 |
운영 프로세스(NHEJ-GFP 시스템의 경우):
구문 포함GFP-TAA 종료 하위의 편집 캐리어(sgRNA 표적 TAA 영역).
세포를 전염시킨 후, NHEJ는 파괴 종지자 → GFP 발현을 복구합니다.
72h 이후 사용유동식 세포계 (예: iQue®)GFP ⁺세포 선별。
획기적인 방안: 50개의 세포만으로 유전자형 감정을 완료할 수 있으며, 주기를 15일 이상 단축할 수 있다.

주요 매개 변수:
세포량: ≥ 50 개 (20 세포 그룹 검출률 부족, P<0.01).
효소 절삭 감도: T7E1은 ≥ 5%의 편집 효율성을 감지합니다.
검증 단계: Sanger 시퀀싱은 삽입 / 누락과 같은 돌연변이 유형을 확인합니다.
| 방법 | 원리 | 적용 시나리오 | 제한 |
|---|---|---|---|
| T7E1 효소 절단 | 잘못된 가공으로 인해 이기종 이중 체인 생성 | 초기 필터 (저비용) | 낮은 감도(≥5% 편집률) |
| Sanger 시퀀싱 | 직접 읽기 시퀀스 변이 | 단일 클론 인증 | 통량이 낮다 |
| 하이패스 시퀀싱 | 깊이 커버 표적 위치 돌연변이 | 다중 유전자 / 탈표적 분석 | 成本高 |
운영 최적화:
클론 사전 필터링 블렌드: FA-PCR이 그룹 편집률을 감지하고 > 30% 가 되면 클론을 선택합니다.
이중 검증 정책: T7E1 초체 양성 클론 → Sanger 시퀀스 확인 (가짜 양성은 피하십시오).
| 세포 유형 | 추천 방법 | 이유 |
|---|---|---|
| 원대세포 | 미량세포감정법 | 장기 배양 노화 방지 (돼지 섬유질 세포) |
| 종양세포계 | 항생제 선별 + FACS | 증식이 빠르고 내약성이 안정적이다 |
| iPSC는 | HDR 보고 시스템 + 단일 클론 시퀀싱 | 다능성 유지, 고정밀 편집 필요 |
| 유형 편집 | 필터링 기술 | 핵심 지표 |
|---|---|---|
| 유전자 박제(KO) | NHEJ-GFP 보고 시스템 | GFP ⁺ 세포 점유율(유식 정량) |
| 유전자 입력(KI) | 항생제 선별 + PCR 검증 | 저항 생존율 + 측면 서열 증가 |
| 점 돌연변이(PM) | T7E1 + 깊이 시퀀싱 | 돌연변이 빈도 > 90% |
유전자 편집 양성 세포 선별